Skladno s 1. točko prvega odstavka 203. člena ZJU so z dnem, ko se je ZJU začel uporabljati (to je z 28. junijem 2003) prenehale veljati naslednje določbe Zakona o delavcih v državnih organih (Uradni list RS, št. 15/90, 5/91, 18/91, 22/91, 2/91-I, 4/93, 18/94 – ZRPJZ, 70/97, 87/97 – ZPSDP in 38/99): I. poglavje, II. poglavje (razen 34. do 42. člena, ki veljajo do nove ureditve s kolektivno pogodbo), drugi odstavek 65. člena in V. ter VI. poglavje. Upoštevajoč navedeno torej za določanje števila dni letnega dopusta in za določanje o odsotnosti z dela s pravico do nadomestila plače še vedno veljajo določbe 34. do 42. člena ZDDO, in sicer do nove ureditve s kolektivno pogodbo. Kolektivna pogodba, ki bi uredila letni dopust in druge odsotnosti z dela za javne uslužbence v državnih organih in občinah, namreč še ni sprejeta.